El colegio se creó aproximadamente en el 1990. En el barrio villa mercedes primer  sector ubicado en un lugar llamado el tanque ahí el colegio fue construido con tablas de madera y tejas.

Dentro de las maestras pioneras que conformaron el grupo docente de nuestra institución y que aún gozamos de su labor son:

Yolanda Ramírez

Flor Alba Chía

En 1992 la institución se trasladó para  donde actualmente está ubicado.

En el 2004 la fundación PIES DESCALZOS trabajó con la institución educativa y benefició a 1.414 niños, niñas y jóvenes, igualmente trabajaban con 814 familias del sector.

Gracias a la gestión de nuevos recursos se construyó una sede adicional en el barrio Minuto De Dios con 6 aulas una ludoteca y un comedor escolar.

La Institución educativa Gabriel García Márquez cuenta con 13 salones un comedor un aula de informática y las oficinas para la parte directiva.

La alcaldía de Soacha, la gobernación de Cundinamarca y la fundación Ayuda En Acción en el año 2011 construyeron 6 nuevas aulas y un polideportivo comunitario.

Las dos sedes cuentan con 39 docentes 2 coordinadores y la rectora es la Licenciada Elvia María Rodríguez Ibáñez.